Die Elektrophorese wird in der Regel im Rahmen einer komplexen Behandlung verschiedener Erkrankungen (in Kombination mit anderen Therapieverfahren) eingesetzt und beschleunigt den Heilungsprozess. Zu prophylaktischen Zwecken kann die Elektrophorese auch als eigenständige Methode angewendet werden.
Die Elektrophorese wird häufig bei folgenden Erkrankungen eingesetzt:
- Erkrankungen der Gelenke und Knochen (Arthritis, Polyarthritis, Osteochondrose, Bandscheibenprotrusionen und -hernien)
- HNO-Erkrankungen (Tonsillitis, Sinusitis, Otitis)
- Entzündliche Erkrankungen des weiblichen Fortpflanzungssystems (Endozervizitis, Endometriose, Endometritis, Kolpitis, Zervixerosion)
- Prostatitis, Zystitis, Pyelonephritis
- Behandlung von chronischer Bronchitis
- Herz-Kreislauf-Erkrankungen
- Atherosklerose
- Hypertonie
- Hypotonie
- Behandlung von Narben und Verwachsungen nach Operationen, Verletzungen und Entzündungen
- Erkrankungen des Nervensystems (Radikulitis, Neuralgie usw.), Schlafstörungen, Neurosen, Migräne
- Sehnenzerrungen und -verletzungen, Ödeme, Schmerzsyndrom
- Die Elektrophorese wird in der Pädiatrie широко angewendet


